1.5. Clasificación de las proteínas

Actualmente se tiende a clasificar las proteínas según criterios estructurales (según la abundancia y distribución de estructuras secundarias y supersecundarias) y evolutivos (al comparar secuencias de aminoácidos y estructuras de dominios se revelan sus proximidades filogenéticas). Se han construido así bancos de datos como SCOP (Structural Classification of Proteins). Más tradicionalmente se han clasificado las proteínas atendiendo a su composición química, dividiéndolas en:

1. Holoproteínas

   Están constituidas solo por aminoácidos. Pueden ser fibrosas o globulares.

2. Heteroproteínas

   Su composición incluye una molécula no proteínica llamada grupo prostético. Son todas globulares y se clasifican según la naturaleza química de este grupo:

   • Lipoproteínas. Son macromoléculas constituidas por una parte central que contiene lípidos apolares (colesterol esterificado y triacilgliceroles) y una capa externa polar formada por fosfolípidos, colesterol libre y proteínas. Algunas lipoproteínas, como las de la membrana plasmática, tienen un papel estructural; mientras que otras, como es el caso de las lipoproteínas sanguíneas, se encargan de transportar el colesterol y las grasas. Estas lipoproteínas sanguíneas (véase el recuadro “¿Colesterol bueno y colesterol malo?” al final de este apartado) se dividen, en función de su tamaño y composición, en quilomicrones (QM), lipoproteínas de muy baja densidad (VLDL, por sus iniciales en inglés: very low density lipoproteins), lipoproteínas de densidad intermedia (IDL, intermediate density lipoproteins), lipoproteínas de baja densidad (LDL, low density lipoproteins) y lipoproteínas de alta densidad (HDL, high density lipoproteins).
   • Glucoproteínas. Poseen glúcidos como grupo prostético. A este grupo pertenecen diversas hormonas, los proteoglucanos del líquido sinovial, de las secreciones mucosas o de la pared bacteriana, algunas enzimas, las glucoproteínas que se hallan en las membranas celulares...
   • Cromoproteínas. Su grupo prostético es un pigmento. Un ejemplo es el grupo hemo de la hemoglobina, especializado en el transporte de O₂ y CO_2:
     
     Estructura y función de un grupo hemo (rojo). (Fuente: ASH).
   • Fosfoproteínas. En este caso el grupo prostético es ácido fosfórico (H₃PO₄). Se detectan, por ejemplo, en la yema de huevo (vitelina) y en la leche (caseína).
   • Nucleoproteínas. El grupo prostético es un ácido nucleico (véase la Unidad 4), que puede ser ARN (un ejemplo son los ribosomas) o ADN (como los cromosomas eucarióticos).